Корпус — сердце модульных стереомикроскопов. Он содержит объективы и призмы, которые захватывают изображение препарата, увеличивают его и направляют в окуляры. Отдельно корпус микроскопа нельзя использовать для наблюдения объекта, требуются окуляры для увеличения изображения и штатив с механизмом для подъема и опускания корпуса для фокусировки препарата.
Стереомикроскопы EMT имеют две пары объективов на турели, что позволяет пользователю переключать увеличение (например с 10x до 30x). Они более экономичные, чем стереомикроскопы ZOOM серии EMZ, но менее гибкие. Стереомикроскопы Meiji Techno предоставляют 4 различных варианта увеличения для моделей с тринокуляром и бинокуляром, а также специальный корпус с расширенным рабочим расстоянием, предназначенный для пользователей, которым требуется дополнительное пространство для рук под микроскопов. Все модели серии EM поставляются с защитными чехлами и резиновыми наконечниками для окуляров.